Bahwa Perguruan Tinggi adalah pusat penyelenggaraan dan pengembangan ilmu pengetahuan, teknologi dan/atau kesenian, sebagai suatu masyarakat ilmiah yang penuh cita-cita luhur, guna mencerdaskan kehidupan bangsa dalam rangka mencapai tujuan nasional sebagaimana tercantum dalam pembukaan Undang-Undang Dasar 1945.
Dalam rangka ikut berperan serta dalam proses mencerdaskan bangsa, maka pada tanggal 4 September 2017 Yayasan Kesehatan Nasional Baubau mendirikan perguruan tinggi dengan nama Politeknik Baubau atas hasil penggabungan Akademi Kebidanan Yayasan Kesehatan Nasional Baubau dengan Akademi Tenaga Kesehatan Baubau berdasarkan SK Kemenristek Dikti Nomor 478/KPT/I/2017. Dalam kedudukannya sebagai perguruan tinggi yang mandiri, Politeknik Baubau merupakan bagian dari sistem pendidikan nasional yang berdasarkan Pancasila dan Undang-Undang Dasar 1945 bertujuan menyiapkan peserta didik menjadi anggota masyarakat yang memiliki kemampuan kecakapan dan keterampilan dalam pengembangan/penyebarluasan ilmu pengetahuan, teknologi dan/atau kesenian serta mengupayakan penggunaannya bagi masyarakat, bangsa dan negara.
Bahwa Politeknik Baubau sebagai perguruan tinggi yang berkedudukan di Baubau, memiliki tugas tanggung jawab untuk mengembangkan sumberdaya manusia sesuai kebutuhan bangsa, baik di wilayah Baubau maupun di seluruh wilayah Negara Kesatuan Republik Indonesia, dengan mengingat pula kedudukannya sebagai salah satu bagian dari masyarakat ilmiah yang bersifat universal.
Politeknik Baubau menyelenggarakan pendidikan tinggi dengan tekad dan semangat tri dharma untuk mewujudkan learning to know, learning to be, learning to do, learning to live together. Di dalam komunitas akademik, Politeknik Baubau menjalankan pendidikan dan pembelajaran, penelitian, serta pengabdian kepada masyarakat dengan memperhatikan secara sungguh-sungguh etika akademik. Dengan demikian sebagai komunitas akademik dan sekaligus komunitas etik, Politeknik Baubau harus dilandasi kebebasan akademik dan otonomi keilmuan.
Saat ini, Politeknik Baubau menaungi 2 Jurusan yakni jurusan Kesehatan dan Jursan Ekonomi dan Bisnis.
Jurusan Kesehatan menuangi 3 Program studi yaitu :
Jurusan Ekonomi dan Bisnis Menaungi 5 (lima) Program Studi yaitu :